PCR再開

前回まで、なかなかうまくDNAを増幅できなかったのは乾燥標本から抽出したサンプルでしたが、やり方が適切でなかった可能性があったので、改めて抽出作業を行いPCRに望みました。この夏に採集した生標本から抽出したサンプルと合わせて72サンプルを一気にサーマルサイクラーにセットし結果を見てみると、スメアとなってしまっているサンプルが多いという結果になってしまいました。

電気泳動漕の下段右端の2つはバンドが検出されターゲットなる領域が順調に増幅されていますが、それ以外は不明瞭に伸張してしまっています。スメアとよばれる状態ですが、ターゲットとなる領域以外の細かいDNA断片も増幅されてしまっているということです。コンタミあるいは、もともとDNAが断片化してしまっている、いずれかを疑うべきでしょう。

Fig.1


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牛肝菌研究所 by yuichi taneyama










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